Aus der reichhaltigen Chorliteratur des 19. Jahrhunderts ragen im Repertoire des Tölzer Knabenchores Felix Mendelssohn-Bartholdys Motetten und Franz Schuberts Vokalquartette sowie einige seiner Messen heraus. Die große romantische Chormusik ist mit Werken von Robert Schumann und Johannes Brahms vertreten. In Anlehnung an Wiener Traditionen pflegt man beim Tölzer Knabenchor außerdem die Bearbeitungen von Walzern und Polkas von Johann Strauß.
Im 20. Jahrhundert zählte Benjamin Britten zu jenen Komponisten, die besonders feinfühlig für reine Knabenchorbesetzung komponieren konnten. Seine Missa Brevis ist ein Herzstück des Tölzer Knabenchores. Zweiter wichtiger moderner Komponist für den Tölzer Knabenchor ist Carl Orff, zu dem der oberbayerische Chor von Anfang an eine enge Beziehung unterhielt. Zu Lebzeiten Orffs fanden viele Aufführungen und Plattenaufnahmen zusammen mit dem Komponisten statt, der Chor trug das Orff-Schulwerk auf Tourneen auch in andere Länder. Bis heute zählen Orffs Tanzlieder und Singspiele zum fixen Bestandteil des Tölzer Repertoires.
Dazu kommen Aufgaben in Konzerten mit Chor-Orchesterwerken. Regelmäßig wird der Tölzer Knabenchor von renommierten Dirigenten und internationalen Konzertveranstaltern eingeladen, die Knabenchöre in Gustav Mahlers Symphonien Nr. 3 und Nr. 8 zu singen. Tölzer Solisten singen die Knabenpartien im „Klagenden Lied“ und das Sopransolo der Symphonie Nr. 4 Mahlers sowie das Knabensolo in Leonard Bernsteins „Chichester Psalms“. Besonders anspruchsvolle Choraufgaben bewältigte der Tölzer Knabenchor in Brittens „War Requiem“ und mit der Uraufführung von Krzysztof Pendereckis Lukas-Passion.
Leonard Bernstein
„Chichester Psalms“ (Knabensolo)
Johannes Brahms
Motetten op. 29/1 „Es ist das Heil uns kommen her“ und 29/2 „Psalm 51“ „Regina coeli laetare“. Geistlicher Chor op. 37/3
Benjamin Britten
Missa brevis in D „War Requiem“
„A Ceremony of Carols“
Anton Bruckner
„Ave Maria“
Hugo Distler
Motetten „Lobet den Herrn“, „Singet dem Herrn ein neues Lied“ und „Der Feuerreiter“
Gabriel Fauré
„Requiem“
Hans Werner Henze
„Musen Siziliens“ (nach Vergil)
Arthur Honegger
„Weihnachtskantate“
Gustav Mahler
„Symphonie Nr. 3 d-Moll („Glockenchor“, 5. Satz)
Symphonie Nr. 8 Es-Dur (Chor seliger Knaben, 2. Satz)
Symphonie Nr. 4 G-Dur (Sopransolo „Wir genießen die himmlischen Freuden“, 4. Satz) „Das Klagende Lied“
(Sopran- und Altsolo)“
Felix Mendelssohn-Bartholdy
Aus: „Elias“. Oratorium op. 70:
Solo-Knabe und Terzett „Hebe Deine Augen auf“
Motetten op. 39/1 „Veni Domine“, 39/2 „Laudate pueri“,
39/3 „Surrexit pastor bonus“
Drei Psalmen für Chor und Soli op. 78
Aus: Sechs Chorlieder „im Freien zu singen“
op. 59: Nr. 4 „Die Nachtigall“
Aus: Psalm 115 op. 31: Nr. 4 „Auf dem See“
Schauspielmusik zu „Ein Sommernachtstraum“
op. 61
(„Elfen-Chöre“)
„Hör mein Bitten, Herr“. Hymne für gemischten Chor,
Sopransolo und Orgel
Carl Orff
Schulwerk „Comoedia de Christi Ressurectione“. Ein Osterspiel
Weihnachtsgeschichte „Ludus de nato Infante mirificus“.
Ein Weihnachtsspiel
Tanzlieder
Krzysztof Penderecki
„Lukas-Passion“
Gioachino Rossini
„Drei religiöse Chöre: „La carita“, „La Fede“, „La speranza““
Franz Schubert
„Mirjams Siegesgesang“. Kantate für Sopransolo, Chor und Klavier D 942 Der 23. Psalm. Quartett für Sopran- und Altstimmen mit Klavier D 706
„Gott in der Natur“. Quartett für Sopran- und Altstimmen mit Klavier D 757
Quartette für gemischten Chor mit Klavier: „Gott im Ungewitter“ D 985, „Gott, der Weltschöpfer“ D 986, „Hymne an den Unendlichen“ D 232, „Gebet“ D 815
Messe C-Dur D 452
Messe F-Dur D 105
Messe G-Dur D 167
Deutsche Messe D 872
Robert Schumann
„Das Zigeunerleben“ op. 29/3 „Die Nachtigall“ op. 103/3
„Szenen aus Goethes Faust“ (Chor seliger Knaben, Dritte Abteilung)
Johann Strauß Sohn
„Rosen aus dem Süden“. Walzer, „Annenpolka“„Tritsch-Tratsch-Polka“ „Pizzicato-Polka“ „Kaiserwalzer“
Igor Strawinsky
„Symphonie de Psaumes“ „Pater noster“